SNP（single nucleotide polymorphism）原理

    SNP（single nucleotide polymorphism），即單(dān)核(hé)苷酸多態(tài)，是由(yóu)於(yú)單個核(hé)苷酸(suān)改(gǎi)變而導致(zhì)的核(hé)酸序(xù)列多態。一(yī)般來說(shuō)，一(yī)個SNP位點(diǎn)隻(zhī)有兩(liǎng)種(zhǒng)等(děng)位(wèi)基(jī)因，因此(cǐ)又叫雙等位基因(yīn)。SNP在(zài)人(rén)基因(yīn)組中的(dí)發生頻(pín)率比較(jiào)高，大約平(píng)均每1000個鹼基中就(jiù)有一(yī)個多態位點，是(shì)繼(jì)微衛星(xīng)之後的第三代(dài)遺(yí)傳標(biāo)記。有(yǒu)些(xiē)SNP位點還會(huì)影響基(jī)因的(dí)功(gōng)能(néng)，從(cóng)而導(dǎo)致生(shēng)物性狀(zhuàng)改變甚(shèn)至致病。SNP廣泛(fàn)用於(yú)群體(tǐ)遺傳(chuán)學研(yán)究(jiū)（如(rú)生物(wù)的起源，進(jìn)化及遷移等方麵，將(jiāng)逐漸取(qǔ)代(dài)微衛(wèi)星而成(chéng)為新(xīn)一代的分子(zǐ)生(shēng)物學標(biāo)記）和(hé)疾病相關基因的研究(jiū)，在藥(yào)物基因組(zǔ)學，診斷(duàn)學和生物醫學(xué)研(yán)究中起(qǐ)重要(yào)作(zuò)用。

Multiplex SNaPshot SNP分型法(fǎ)

SNaPshot SNP分型(xíng)法

    是(shì)基於(yú)熒(yíng)光(guāng)標記(jì)單鹼基(jī)延(yán)伸原理的分型技術，也稱小測(cè)序(xù)，主要(yào)針對(duì)中(zhōng)等通(tōng)量的SNP分(fēn)型項目。在一個(gè)含(hán)有(yǒu)測(cè)序酶(méi)，四(sì)種熒光標(biāo)記(jì)ddNTP，緊臨多態(tài)位點5’-端的不同(tóng)長度(dù)延(yán)伸引(yǐn)物和(hé)PCR產(chǎn)物(wù)模板的(dí)反(fǎn)應體係(xì)中，引物(wù)延伸一個鹼基(jī)即(jí)終止，經(jīng)ABI測序儀檢測(cè)後，根據峰(fēng)的移(yí)動(dòng)位置(zhì)確定(dìng)該(gāi)延伸產(chǎn)物(wù)對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn)，根據峰(fēng)的顏色可(kě)得知(zhī)摻入的鹼(jiǎn)基(jī)種類(lèi)，從(cóng)而確(què)定(dìng)該樣本(běn)的(dí)基因(yīn)型(xíng)。對於PCR產物(wù)模板可通過(guò)多重PCR反應體係來獲得。通(tōng)常(cháng)用(yòng)於10-30個SNP位(wèi)點分(fēn)析(xī)。

SNaPshot SNP分型(xíng)法服(fú)務(wù)流程

 1. 客戶提供：

 1）.已純化基因(yīn)組DNA，並填(tián)寫詳(xiáng)細基(jī)因組DNA量(liáng)，濃度及純度

 2）.或(huò)提供(gōng)新(xīn)鮮(xiān)的組(zǔ)織(zhī)，血液，細(xì)胞樣(yàng)本；且盡量(liáng)多的材料

 3）.提(tí)供已(yǐ)知的(dí)基(jī)因序(xù)列或物種(zhǒng)基(jī)因序(xù)列號；盡可(kě)能詳細(xì)的背(bèi)景(jǐng)資(zī)料。

2.設計(jì)PCR 擴(kuò)增(zēng)含(hán)SNPs 位點(diǎn)的一段(duàn)DNA序(xù)列(liè)。

3.對PCR 產物(wù)進行純化(huà)（去除引(yǐn)物和dNTP）。

4.引物延(yán)伸(shēn)。

5.延伸(shēn)產物(wù)測序(xù)。

6.提供(gōng)：峰圖文(wén)件（abl.格式），序列文件（seq.格式）；正式的數據分(fēn)析(xī)報告。

樣本運(yùn)輸(shū)：

  客戶(hù)根據溫度，所在(zài)區域(yù)及樣(yàng)本類(lèi)型的(dí)差異，以(yǐ)加冰袋或(huò)幹冰(bīng)運輸(shū)，並保證(zhèng)樣本(běn)的密封性和完(wán)整性，以免(miǎn)造(zào)成不必要(yào)的汙染和損(sǔn)耗。