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:細胞克隆(lóng)中,對培養的細(xì)胞來說(shuō),從(cóng)原有的克隆中,再篩選出具有某種特性(xìng)的細胞(bāo)進行培養(yǎng),就(jiù)是(shì)subclone,分為(wéi)細胞克(kè)隆和(hé)分子克隆。
一,
1,掌握(wò)細菌基因組(zǔ)提取(qǔ)的(dí)方(fāng)法和(hé)原(yuán)理。
2,掌(zhǎng)握限(xiàn)製(zhì)性核(hé)酸(suān)內切(qiē)酶處理(lǐ)基因組(zǔ)及其(qí)結(jié)果分(fēn)析。
3,掌(zhǎng)握基因(yīn)片段回收(shōu)的方(fāng)法(fǎ)。
二(èr),
細(xì)菌基因組的(dí)提(tí)取:通(tōng)過(guò)鹼(jiǎn)法或(huò)者酶法裂(liè)解細(xì)菌(jūn)之(zhī)後(hòu),可(kě)以將胞內的(dí)核(hé)酸和蛋(dàn)白(bái)質全釋(shì)放(fàng)出來(lái)。DNA溶(róng)於(yú)1mol/L的NaCl中,不(bù)溶於(yú)0.14mol/L的NaCl,而RNA溶於(yú)0.14mol/L的NaCl不(bù)溶(róng)於(yú)1mol/L的NaCl中(zhōng),通過溶(róng)液中(zhōng)鹽濃度(dù)的變(biàn)化可以(yǐ)將(jiāng)DNA和RNA分(fēn)開(kāi)。氯仿(fǎng)-異(yì)戊(wù)醇(chún)法除(chú)去蛋白(bái),2倍體積乙(yǐ)醇將DNA沉(chén)澱出來。
限製(zhì)性核(hé)酸內切酶(méi)隻作(zuò)用(yòng)於(yú)特(tè)定(dìng)的(dí)位(wèi)點(diǎn),處理基因組後隻會(huì)得到有(yǒu)限(xiàn)的(dí)片斷。通過單酶切或者多酶切後電泳檢驗就(jiù)可以(yǐ)得(dé)到與物(wù)種本身(shēn)有關的(dí)特(tè)定(dìng)的圖譜(pǔ)。
電泳後選定目(mù)的(dí)基因的條(tiáo)帶,紫外燈(dēng)下(xià)將含(hán)有目(mù)的基因的凝(níng)膠(jiāo)切下,使(shǐ)用凝(níng)膠(jiāo)回收試(shì)劑盒,將(jiāng)凝(níng)膠(jiāo)溶化後(hòu),通(tōng)過吸(xī)附柱時,核酸片(piàn)段(duàn)就吸附(fù)在(zài)柱上,洗脫(tuō)液洗(xǐ)脫後加入(rù)2倍體(tǐ)積乙醇,核酸沉澱(diàn),TE溶(róng)解(jiě)沉(chén)澱(diàn),核(hé)酸(suān)片(piàn)段(duàn)得(dé)到回收。
三,試劑與器(qì)材
1,試劑(jì) E.coli JM109,牛肉膏,胰蛋白腖,NaCl,微(wēi)量細(xì)菌基(jī)因組抽(chōu)提試劑(jì)盒(上海(hǎi)生工(gōng)),BamH I,Xho1 核(hé)酸內(nèi)切酶(Takara),NEB 標(biāo)準(zhǔn)分子(zǐ)量片(piàn)段(duàn)(1kb DNA Ladder),凝膠電泳(yǒng)回收試(shì)劑(jì)盒
2,器材(cái) 高速台式冷(lěng)凍(dòng)離(lí)心機,水平電泳(yǒng)儀(yí),漩渦(wō)混合儀(yí),紫外(wài)檢測(cè)儀(yí),凝膠(jiāo)成(chéng)像分析係統,微量移液器(qì)及(jí)吸頭(tóu)。
四(sì),操作方法
1.使用(yòng)LB培養(yǎng)基活化,培(péi)養(yǎng)菌體。
2.離(lí)心收集菌體(tǐ),根(gēn)據(jù)試劑盒(hé)說明提取(qǔ)基因組。
3.限製性酶處理基(jī)因組(zǔ)。
4.E.coli JM109的基(jī)因組經(jīng)過限製性內切酶處(chǔ)理後,使用(yòng)瓊(qióng)脂糖凝膠(jiāo)電泳檢測(cè),凝膠(jiāo)成(chéng)像係統將酶(méi)切圖譜采集下(xià)來並對(duì)其分析。
5.紫(zǐ)外燈下將需要(yào)回收的(dí)核酸片(piàn)段(duàn)切下來(lái),使用(yòng)凝(níng)膠(jiāo)回(huí)收試劑盒回收DNA片段。
6.電(diàn)泳檢(jiǎn)測回(huí)收的(dí)核(hé)酸(suān)片段。
五(wǔ),關鍵(jiàn)步(bù)驟(zhòu)與注意事項
1.菌(jūn)體(tǐ)培(péi)養過(guò)程要(yào)嚴(yán)格(gé)無菌(jūn),染菌(jūn)後(hòu)提(tí)取(qǔ)得到(dào)的基因組會(huì)成多條帶,酶切(qiē)的圖(tú)譜(pǔ)也會(huì)比(bǐ)較復雜(zá)。
2.基因(yīn)組提(tí)取過(guò)程中所(suǒ)使用的器材要嚴格(gé)滅菌,防止(zhǐ)核(hé)酸酶(méi)降解(jiě)基(jī)因組。
3.基因組提取過程不可以(yǐ)劇烈(liè)振(zhèn)蕩(dàng),防止(zhǐ)DNA斷鏈(liàn)。
4.在內切酶zui適條(tiáo)件(jiàn)下充(chōng)分處(chǔ)理基(jī)因組(zǔ),得(dé)到正確的圖(tú)譜(pǔ)。
5.瓊脂糖溶化要充分(fēn)。
6.切下凝膠時(shí)要注意防護紫外(wài)綫(xiàn),電泳(yǒng)結束之後(hòu)盡(jìn)快將膠條切下來(lái),凝膠條要窄,脫尾部分(fēn)不回(huí)收。