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STR檢(jiǎn)測服務(wù)來(lái)分析(xī)分析STR的(dí)原(yuán)理(lǐ)

  • 發布(bù)日(rì)期(qī):2017-11-20      瀏覽(lǎn)次(cì)數:4975
    •    STR檢(jiǎn)測服(fú)務(wù)來分析分析(xī)STR的原理
        短串聯(lián)重(zhòng)復(fù)序(xù)列(liè)(short tandem repeat, STR),也(yě)稱微衛(wèi)星 DNA(microsalite DNA) ,是(shì)由(yóu)2 - 6個鹼基對作為(wéi)核心單(dān)位,串聯(lián)重復形成(chéng)的(dí)一(yī)類(lèi)DNA序列(liè),由於(yú)核(hé)心單位(wèi)重復數目在個體(tǐ)間呈(chéng)高度(dù)變異性並且數量豐富,構成了STR基(jī)因(yīn)座的遺(yí)傳(chuán)多(duō)態性。它分布(bù)於人類整個(gè)基因(yīn)組,平(píng)均每(měi)15 kb就(jiù)存(cún)在一個STR基因(yīn)座(zuò)。人(rén)類(lèi)基因組(zǔ)內已發現(xiàn)了(liǎo)七千(qiān)個(gè)以(yǐ)上的STR位(wèi)點(diǎn)。它(tā)具(jù)有分(fēn)布(bù)廣泛,易(yì)於(yú)檢測,信息量(liáng)大,有高度多態(tài)性(xìng)並遵循(xún)孟德(dé)爾(ěr)共顯性遺傳(chuán)等優(yōu)點。是繼限製性(xìng)片段(duàn)長度多態(tài)性 (RFLP) 之(zhī)後的第(dì)二代遺傳記(jì),目前STR分析(xī)已(yǐ)廣泛應用(yòng)於遺(yí)傳(chuán)製圖,連鎖性分(fēn)析,法醫學鑒定(dìng),疾病基因定位,物(wù)種多態(tài)性和(hé)遺(yí)傳病的診(zhěn)斷(duàn)等諸多領(lǐng)域。
        微(wēi)衛星(STR)檢測服(fú)務流(liú)程(chéng)
        1. 客戶(hù)提(tí)供
        A.如果(guǒ)提供(gōng)基(jī)因(yīn)組(zǔ)DNA:至(zhì)少(shǎo)提(tí)供100 ng DNA樣品(pǐn)(針(zhēn)對(duì)每個多(duō)態性(xìng)位(wèi)點(diǎn),需(xū)樣(yàng)品(pǐn)3-5 ul,濃度(dù)為(wéi)30 - 50 ng/ul)
        B.如(rú)果提(tí)供PCR產(chǎn)物:產物要(yào)通(tōng)過預(yù)實驗(yàn)的(dí)電泳(yǒng)檢測,特異性要(yào)好(hǎo)
        C.如(rú)果需要設(shè)計(jì)引(yǐn)物,請(qǐng)提供目的片(piàn)段(duàn)序(xù)列或(huò)者微(wēi)衛星(xīng)檢(jiǎn)測位點(diǎn),引物設計好後需(xū)要客戶(hù)確認。
        D.除(chú)提(tí)供樣(yàng)品類(lèi)型(xíng),DNA濃度(dù)和純(chún)度值(zhí)外,還(huán)需要注明可能(néng)殘留的抑製劑成分(fēn)。樣(yàng)品溶解在ddH2O中(zhōng),如果(guǒ)不(bù)是(shì),請注明(míng)溶(róng)解液(yè)成(chéng)分。
        2. 確(què)定(dìng)STR位(wèi)點,設(shè)計實驗(yàn)方案(àn),包括(kuò)熒光標記的選擇,引物的(dí)設(shè)計,合成和標記,熒(yíng)光(guāng)分(fēn)子(zǐ)量(liáng)內標(biāo)的選(xuǎn)用等(děng)。
        3. 按照(zhào)所(suǒ)設計的實驗方案完成(chéng)熒(yíng)光PCR,利用瓊(qióng)脂(zhī)糖電泳(yǒng)檢測結(jié)果;若(ruò)PCR產(chǎn)物特(tè)異(yì)性(xìng)不(bù)夠,將(jiāng)進行(háng)優(yōu)化(huà)。
        4. PCR產物通(tōng)過(guò)ABI 3730XL 測序儀器(qì)進行毛(máo)細(xì)管(guǎn)電泳(yǒng)檢(jiǎn)測(cè),獲得(dé)擴增片(piàn)段大(dà)小(xiǎo)的(dí)數(shù)據(jù)
        5. 用(yòng)GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或(huò)GeneMapper 3.2等(děng)軟(ruǎn)件對(duì)收(shōu)集(jí)到(dào)的數據進行處理分(fēn)析(xī),將(jiāng)產(chǎn)物片段(duàn)大小,數量多少(shǎo)的信息(xī)轉(zhuǎn)化成直觀(guān)準確的波(bō)形圖譜(pǔ),為(wéi)下一步(bù)進行(háng)關聯(lián)分析或連鎖(suǒ)分析(xī)等遺(yí)傳分析(xī)提供(gōng)可靠(kào)的數據。
        6.發(fā)送準(zhǔn)確(què)的(dí)微衛(wèi)星(STR)分型結果(guǒ)報(bào)告(gào)及(jí)PCR產物。